arvutiteaduse instituudi lõputööderegister


Beetainterferooni signaaliraja aktiivsust mõjutavate geneetiliste variantide tuvastamine
Nimi Ralf Tambets
Kokkuvõte Beetainterferoon on inimorganismi põletikuvastuses tähtsal kohal olev biomolekul. See on osa laiast põletikuvastasest geenivõrgustikust, mille toimemehhanism ei ole veel lõplikult selge. Käesolevas töös püüti nelja populatsiooni andmetele tuginedes ülegenoomsete assotsiatsioonuuringute abil tuvastada selle signaaliraja aktiivsust mõjutavaid seni välja selgitamata geneetilisi variante. Selleks käsitleti beetainterferooni kodeerivas IFNB1 lookuses olevaid geneetilisi variante trans-eQTLidena ja selgitati välja nendega kõige tugevamas seoses olev geen. Leitud geeni beetainterferooni signaalraja markergeenina kasutades üritati tuvastada täiendavaid signaalraja aktiivsust mõjutavaid trans-eQTLe väljaspool IFNB1 lookust. IFNB1 lookuse seos IFI6 geeniga õnnestus replitseerida nii Fairfax_2014 andmestikus, kus see esmakordselt tuvastati, kui ka ülejäänud kolmel populatsioonil. Lõpliku valimi väiksuse (n=685) tõttu uusi seoseid tuvastada ei õnnestunud.
Lõputöö keel eesti
Lõputöö tüüp Bakalaureus - Informaatika
Juhendaja(d) Kaur Alasoo
Kaitsmise aasta 2021
PDF